De H.-Magdalenakerk is nog steeds een parochiekerk. De parochie H.-Magdalena viert er liturgie, meestal in het koor.
De komst van YOT lokte natuurlijk discussie uit: de herinrichting van het schip leidde ertoe dat sommige parochianen de kerk de rug toekeerden. Maar de parochie maakt ook dankbaar gebruik van wat YOT in de kerk aanbiedt en integreert de evenementen in haar liturgie. Zo stimuleren de YOT-projecten de parochiale vieringen in liturgisch sterke tijden zoals de veertigdagentijd, Goede week of advent.
De parochie maakt deel uit van de federatie Sint-Donatianus, die o.a. alle parochies van de binnenstad verenigt. Pastoor Luc Gruwet is eveneens verbonden met de parochies St.Anna en H.Familie.